Fran Mérida abandona el Atlético de Madrid y firma por el Hércules de Segunda División. El centrocampista catalán llegó en verano de 2010 procedente del Arsenal y en su primera temporada disputó 17 partidos. En su segundo año fue cedido al Braga donde apenas disfrutó de minutos y ante esa situación regresó a Madrid. La temporada se cerró con su participación en 3 partidos.
Los números de Fran en rojiblanco se resumen en 29 encuentros y 3 goles. No pudo disfrutar de la Europa League 2012 al haber disputado ya la competición con el Braga.