Jornada 1 - 26/08/12
Ourense - Atlético de Madrid B
Jornada 2 - 2/09/12
Atlético de Madrid B - Caudal
Jornada 3 - 9/09/12
Leganés - Atlético de Madrid B
Jornada 4 - 16/09/12
Atlético de Madrid B - Zamora
Jornada 5 - 23/09/12
R Madrid C - Atlético de Madrid B
Jornada 6 - 30/09/12
Atlético de Madrid B - Avilés
Jornada 7 - 7/10/12
Atlético de Madrid B - Guijuelo
Jornada 8 - 14/10/12
Tenerife - Atlético de Madrid B
Jornada 9 - 21/10/12
Atlético de Madrid B - Getafe B
Jornada 10 - 28/10/12
Coruxo - Atlético de Madrid B
Jornada 11 - 4/11/12
Atlético de Madrid B - Marino
Jornada 12 - 11/11/12
Sporting B - Atlético de Madrid B
Jornada 13 - 18/11/12
Atlético de Madrid B - Oviedo
Jornada 14 - 25/11/12
Fuenlabrada - Atlético de Madrid B
Jornada 15 - 2/12/12
Atlético de Madrid B - San Sebastián de los Reyes
Jornada 16 - 9/12/12
Alcalá - Atletico de Madrid B
Jornada 17 - 16/12/12
Atlético de Madrid B - Salamanca
Jornada 18 - 22/12/12
Marino - Atlético de Madrid B
Jornada 19 - 6/1/13
Atlético de Madrid B - Rayo Vallecano B
Segunda vuelta
Jornada 20 - 13/01/13
Atlético de Madrid B - Ourense
Jornada 21 - 20/1/13
Caudal - Atlético de Madrid B
Jornada 22 - 27/1/13
Atlético de Madrid B - Leganés
Jornada 23 - 3/2/13
Zamora - Atlético de Madrid B
Jornada 24 - 10/2/13
Atlético de Madrid B - R Madrid C
Jornada 25 - 17/2/13
Avilés - Atlético de Madrid B
Jornada 26 - 24/2/13
Guijuelo - Atlético de Madrid B
Jornada 27 - 3/3/13
Atlético de Madrid B - Tenerife
Jornada 28 - 10/3/13
Getafe B - Atlético de Madrid B
Jornada 29 - 17/3/13
Atlético de Madrid B - Coruxo
Jornada 30 - 24/3/13
Marino - Atlético de Madrid B
Jornada 31 - 31/3/13
Atlético de Madrid B - Sporting B
Jornada 32 - 7/4/13
Oviedo - Atlético de Madrid B
Jornada 33 - 14/4/13
Atlético de Madrid B - Fuenlabrada
Jornada 34 - 21/4/13
San Sebastián de los Reyes - Atlético de Madrid B
Jornada 35 - 28/4/13
Atlético de Madrid B - Alcalá
Jornada 36 - 5/5/13
Salamanca - Atlético de Madrid B
Jornada 37 - 12/5/13
Atlético de Madrid B - Marino
Jornada 38 - 19/5/13
Rayo Vallecano B - Atlético de Madrid B