Se ha procedido a sortear el calendario del Campeonato Nacional de Liga 2008 - 2009 en la Real Federación Española de Fútbol con el siguiente resultado en lo que atañe al Atlético de Madrid:
Jornada 1 - Fecha: 31/08/2008
Atlético de Madrid - Málaga
Jornada 2 - Fecha: 14/09/2008
Valladolid - Atlético de Madrid
Jornada 3 - Fecha: 21/09/2008
Atlético de Madrid - Recreativo
Jornada 4 - Fecha: 24/09/2008
Getafe - Atlético de Madrid
Jornada 5 - Fecha: 28/09/2008
Atlético de Madrid - Sevilla
Jornada 6 - Fecha: 05/10/2008
FC Barcelona - Atlético de Madrid
Jornada 7 - Fecha: 19/10/2008
Atlético de Madrid - Real Madrid
Jornada 8 - Fecha: 26/10/2008
Villarreal - Atlético de Madrid
Jornada 9 - Fecha: 02/11/2008
Atlético de Madrid - Mallorca
Jornada 10 - Fecha: 09/11/2008
Osasuna - Atlético de Madrid
Jornada 11 - Fecha: 16/11/2008
Atlético de Madrid - Deportivo
Jornada 12 - Fecha: 23/11/2008
Numancia - Atlético de Madrid
Jornada 13 - Fecha: 30/11/2008
Atlético de Madrid - Racing
Jornada 14 - Fecha: 07/12/2008
Sporting - Atlético de Madrid
Jornada 15 - Fecha: 14/12/2008
Atlético de Madrid - Betis
Jornada 16 - Fecha: 21/12/2008
Espanyol - Atlético de Madrid
Jornada 17 - Fecha: 04/01/2009
Valencia - Atlético de Madrid
Jornada 18 - Fecha: 11/01/2009
Atlético de Madrid - Athletic Club
Jornada 19 - Fecha: 18/01/2009
Almería - Atlético de Madrid
Jornada 20 - Fecha: 25/01/2009
Málaga - Atlético de Madrid
Jornada 21 - Fecha: 01/02/2009
Atlético de Madrid - Valladolid
Jornada 22 - Fecha: 08/02/2009
Recreativo - Atlético de Madrid
Jornada 23 - Fecha: 15/02/2009
Atlético de Madrid - Getafe
Jornada 24 - Fecha: 22/02/2009
Sevilla - Atlético de Madrid
Jornada 25 - Fecha: 01/03/2009
Atlético de Madrid - FC Barcelona
Jornada 26 - Fecha: 08/03/2009
Real Madrid - Atlético de Madrid
Jornada 27 - Fecha: 15/03/2009
Atlético de Madrid - Villarreal
Jornada 28 - Fecha: 22/03/2009
Mallorca - Atlético de Madrid
Jornada 29 - Fecha: 05/04/2009
Atlético de Madrid - Osasuna
Jornada 30 - Fecha: 12/04/2009
Deportivo - Atlético de Madrid
Jornada 31 - Fecha: 19/04/2009
Atlético de Madrid - Numancia
Jornada 32 - Fecha: 22/04/2009
Racing - Atlético de Madrid
Jornada 33 - Fecha: 26/04/2009
Atlético de Madrid - Sporting
Jornada 34 - Fecha: 03/05/2009
Betis - Atlético de Madrid
Jornada 35 - Fecha: 10/05/2009
Atlético de Madrid - Espanyol
Jornada 36 - Fecha: 17/05/2009
Atlético de Madrid - Valencia
Jornada 37 - Fecha: 24/05/2009
Athletic Club - Atlético de Madrid
Jornada 38 - Fecha: 31/05/2009
Atlético de Madrid - Almería